Analiżi In-Silico ta' Antikorpi Monoklonali Kontra SARS-CoV-2 Omicron
Mar 30, 2022
Kuntatt:joanna.jia@wecistanche.com/ WhatsApp: 008618081934791
Astratt
Omicron ġie ddeżinjat mid-WHO bħala VOC fis-26 ta' Novembru 2021, 4 ijiem biss wara li s-sekwenza tiegħu ġiet sottomessa għall-ewwel darba. Madankollu, l-impatt ta' Omicron fuq l-antikorpi u l-vaċċini attwali għadu mhux magħruf u l-evalwazzjonijiet għadhom ftit ġimgħat 'il bogħod. Aħna analizzajna l-mutazzjonijiet fil-varjant Omicron kontra epitopi. Fid-database tagħna, 132 epitopi tal-120 antikorpi huma kklassifikati f'ħames gruppi, jiġifieri NTD, RBD-1, RBD-2, RBD-3, u RBD-4. Il-mutazzjonijiet Omicron jaffettwaw l-epitopi kollha f'NTD, RBD-1, RBD-2, u RBD-3, bl-ebda epitopi tal-antikorpi maħlula minn dawn il-mutazzjonijiet. Erbgħa biss minn 120 antikorpi jistgħu jagħtu reżistenza sħiħa għal mutazzjonijiet fl-Omicron spike peress li l-antikorpi kollha f'dawn it-tliet gruppi fihom epitopi wieħed jew aktar li huma affettwati minn dawn il-mutazzjonijiet. Mill-antikorpi kollha taħt l-EUA, il-potenzjal ta’ newtralizzazzjoni ta’ Etesevimab, Bamlanivimab, Casirivimab, Imdevima, Cilgavimab, Tixagevimab, Sotrovimab, u Regdanvimab jista’ jitrażżan fi gradi differenti. L-analiżi tagħna tissuġġerixxi l-impatt ta 'Omicron fuq l-antikorpi terapewtiċi attwali mill-mutazzjonijiet tal-ispike Omicron jistgħu japplikaw ukoll għal kurrentiCOVID-19 vaċċini.
Kliem ewlieni: SARS-CoV-2;omikron; antikorp; vaċċin
1 Skola tax-Xjenzi Bijomediċi, Li Ka Shing Fakultà tal-Mediċina, Università ta' Ħong Kong,
Ħong Kong, iċ-Ċina; yefanhu@connect.hku.hk
2 Dipartiment tal-Mediċina, Li Ka Shing Fakultà tal-Mediċina, Università ta 'Hong Kong,
Hong Kong, China; tyaucc@hku.hk
3 CAS Laboratorju Ewlenin tal-Bijoloġija Kwantitattiva tal-Inġinerija, Istitut Shenzhen tal-Bijoloġija Sintetika,
Shenzhen Istituti ta 'Teknoloġija Avvanzata (SIAT), Akkademja Ċiniża tax-Xjenzi,
Shenzhen 518055, iċ-Ċina; jc.hu@siat.ac.cn
4 Dipartiment tal-Mikrobijoloġija, Li Ka Shing Fakultà tal-Mediċina, Università ta 'Hong Kong,
Hong Kong, China; hinchu@hku.hk
5 Laboratorju Konġunt ta’ Guangdong-Ħong Kong għall-Mediċina tal-RNA, l-Università ta’ Sun Yat-Sen,
Guangzhou 510120, iċ-Ċina
1. Introduzzjoni
Matul il-kurrentMard tal-koronavirus 2019(COVID-19) ikkawżata minn koronavirus 2 tas-sindromu respiratorju akut sever (SARS-CoV-2), l-Organizzazzjoni Dinjija tas-Saħħa (WHO) qed issegwi l-varjanti tas-SARS-CoV-2 f’termini ta’ varjanti ta' tħassib (VOCs), varjanti ta' interess (VOIs), jew varjanti taħt monitoraġġ (VUMs) [1]. VOCs preċedenti inklużi Alpha (nisel Pango B.1.1.7), Beta (B.1.351), Gamma (P.1), u Delta (B.1.617.2 u AY.*) kienu ġeneralment indikati minn 3 sa 6 xhur wara li ġew irrappurtati l-ewwel. L-iktar VOC reċenti, Omicron (B.1.1.529 jew BA.*), ġie msemmi fis-26 ta' Novembru 2021, 4 ijiem biss wara li s-sekwenza tiegħu ġiet sottomessa għall-ewwel darba [2]. L-azzjoni urġenti kienet imqanqla mill-identifikazzjoni ta 'numru kbir mhux tas-soltu ta' mutazzjonijiet fl-Omicron spike, li jinkludi 10 mutazzjonijiet fid-dominju N-terminal (NTD) u 15-il mutazzjoni fid-dominju li jgħaqqad ir-riċettur (RBD) [3]. Filwaqt li tali numri ta 'mutazzjoni ttardjaw il-validazzjoni tal-impatt fuq l-antikorpi terapewtiċi u l-vaċċini.
Hawnhekk, aħna nevalwaw l-impatt tal-mutazzjoni tal-ispike Omicron fuq il-vaċċini u l-antikorpi billi tuża d-database tagħna tal-antikorpi tal-ispike SARS-CoVs-2. L-analiżi tagħna turi li l-mutazzjonijiet Omicron għandhom impatt fuq l-epitopi kollha f'NTD, RBD-1, RBD-2, u RBD-3, bl-ebda sit ta' rbit ta' antikorpi meħlus minn dawn il-mutazzjonijiet. Erba' antikorpi biss f'RBD-4 jistgħu jagħtu reżistenza sħiħa għal mutazzjonijiet fl-ispike Omicron. Mill-antikorpi kollha taħt l-EUA, il-potenzjal ta’ newtralizzazzjoni ta’ Etesevimab, Bamlanivimab, Casirivimab, Imdevima, Cilgavimab, Tix-Kageyama, Sotrovimab, u Regdanvimab jista’ jitrażżan fi gradi differenti. L-analiżi tagħna tissuġġerixxi l-impatt ta' Omicron fuq l-antikorpi terapewtiċi attwali mill-mutazzjonijiet tal-ispike Omicron jistgħu japplikaw ukoll għal vaċċini attwali tal-COVID-19.
2. Metodi
Aħna miġbura 132 epitopi konformazzjonali kkonfermati bi strutturi ta 'proteini rilaxxati fil-Protein Data Bank (PDB) jew footprints ta' epitopi annotati fil-letteratura. Għal anti-korpi bi strutturi tal-proteini, ir-residwi tal-epitopi ġew ikkalkulati skont il-metodu IEDB [6]; inkella, inġabru pożizzjonijiet parzjali tal-epitopi mir-riżultati ta 'referenza. Dettalji ta' l-antikorpi kollha b'marki ta' epitopi, numri ta' aċċess għall-PDB, u numri DOI ta' referenza huma murija fit-Tabella S1. Xi antikorpi juru epitopi differenti fi studji differenti, u aħna ddokumentajnahom bħala epitopi differenti. Aħna plottajna l-epitopi tal-proteini tal-ispike bl-użu ta 'Microsoft Powerpoint.
kostanche
Fid-database tagħna, 132 epitopi ta' antikorpi monoklonali jistgħu jiġu kklassifikati f'ħames gruppi anti-ġeniċi: NTD [4], RBD-1, RBD-2, RBD-3, u RBD{{6} } [5]. Fost dawn l-epitopi. 19-il epitopi rikonoxxuti minn 19-il antikorpi huma fil-grupp antiġeniku NTD, filwaqt li f'RBD, 114-il epitopi marbutin b'102 antikorpi li jimmiraw lejn l-RBD ta 'spike protein. Hemm 42, 35, 22, u 14-il epitopi dokumentati għall-grupp antiġeniku RBD-1, RBD-2, RBD-3, u RBD-4, rispettivament, Hawnhekk, NTD fih epitopi fdalijiet li jġorru 14-20.27-30.32. 61. 64.66. 68,69,71,76,77,97,98, 124, 140,142-158, 180-183,185-187, 211-218.243-257.259.260. u 262 tal-proteina spike; RBD-1 fih epitopi li jkopru residwi 403-408, 414-417, 420. 421. 432. 439-441. 443-450. 452. 453. 455-460. 470-479. 481-496. 498-505. u 508;RBD-2 fih epitopi li jkopru residwi 372, 403, 405, 406, 408, 409,414-417, 420, 421, 440, 444-446,449,450,453,455-460 , 470,471,473-478,481-487,489,490, 492-496, 498,u 500-505;RBD-3 fih epitopi li jkopru residwi 333-335, 337, 339-347, 349, 351, 354-361.67.368.371-376.378.408.409.414.417,436-439.440-452.455.456.470.472.473.475. 478-494, 498-506, 508,u 509; u RBD-4 fih epitopi li jkopru r-residwi 353-357, 359,360,366,369-372,374-386,388-390,392,394,396,404,405,408,409,{12}},{116}} , 437, 462-466, 468,500-506.508,514-521, u 523.
Aħna użajna l-aktar sekwenzi ta’ Spike Omicron irrappurtati bħala r-referenza (numru ta’ adeżjoni GISAID EPIISL_6590608 u EPI_ISL_6754457)[2].Fl-analiżi tagħna, anti-korp jirreżisti kompletament il- mutazzjonijiet fl-Omicron spike jekk l-ebda mutazzjoni ma tkun identifikata fl-epitopi. Inkella, l-antikorp jista' jiġi affettwat.
3. Riżultati
Mutazzjonijiet fl-Omicron spike huma potenzjalment assoċjati ma 'tnaqqis fl-effettività tal-vaċċini attwali u terapewtiċi bbażati fuq antikorpi. Fid-database tagħna ta' l-antikorpi SARS-CoV-2mon-clonal b'132 informazzjoni ta' epitopi konformazzjonali kkonfermat mill-istruttura ta' 120 antikorpi (Tabella S1), erba' antikorpi biss jistgħu jagħtu reżistenza sħiħa għall-mutazzjonijiet fl-ispike Omicron, peress li l-ebda mutazzjoni ma kienet identifikati fl-epitopi marbuta minn dawn l-antikorpi. L-epitopi tal-antikorpi monoklonali jistgħu jiġu kklassifikati f'ħames gruppi antiġeniċi: NTD [4], RBD-1, RBD-2, RBD-3, u RBD-4 [5] (Figura 1A–E).
Figura 1. Mutazzjonijiet ta' SARS-CoV-2 Omicron u l-epitopi ta' antikorpi monoklonali dokumentati. L-epitopi fuq il-ħames siti antiġeniċi ewlenin (A) NTD, (B) RBD-1, (C) RBD-2, (D) RBD-3, u (E) RBD{{ 6}} huma murija. In-numru ta' mutazzjonijiet Omicron (# Omicron mut) juri n-numru ta' mutazzjonijiet f'kull epitope. Il-kaxxi suwed jindikaw il-mutazzjonijiet tal-ispike Omicron. Il-kaxxi ħomor jimmarkaw l-antikorpi li jistgħu jżommu l-effettività kontra Omicron. Il-kaxxa ħamra b'singetti timmarka tip wieħed ta' epitope EY6A [7] li jista' jkollu reżistenza. Il-klassifikazzjoni tal-epitopi hija bbażata fuq Greaney AJ, et al. [5]. L-epitopi u l-antikorpi paired huma elenkati fit-Tabella S1. (F) Informazzjoni dettaljata ta 'antikorpi terapewtiċi taħt awtorizzazzjoni għall-użu ta' emerġenza (EUA) hija analizzata f'dan l-istudju.
sistanch
Aħna analizzajna l-mutazzjonijiet fl-Omicron spike kontra dawn l-epitopi identifikati qabel. Ir-riżultati tagħna jissuġġerixxu li l-mutazzjonijiet fl-Omicron spike jħallu impatt drammatiku fuq NTD, RBD{{0}}, u RBD{-3 peress li l-antikorpi kollha f'dawn it-tliet gruppi fihom epitopi wieħed jew aktar li huma affettwati minn dawn il-mutazzjonijiet. (Figura 1A-D). Hemm 2.00(żball standard, sd 0.92),3.29(sd,1.79), u 5.86(sd1.22) mutazzjonijiet f'dawn il-gruppi bħala medja, filwaqt li n-numru medju ta' mutazzjoni huwa 1.14(sd1.19) f'RBD-4 għal kull epitope. Importanti, 4 antikorpi mmirati lejn l-RBD-4 juru reżistenza sħiħa għall-mutazzjonijiet fl-ispike Omi-cron (Figura 1E). Tlieta minnhom, inklużi S304 [8], COVOX-45 [9], u S2H97 [10], fihom epitopi li mhumiex affettwati minn mutazzjonijiet fl-Omicron spike. Ħafna minn dawn l-antikorpi ġew murija li għandhom qawwa għolja ta' reattività inkroċjata kontra SARS-CoV-2 VOCs multipli, SARS.CoV-1, jew saħansitra pan-arbovirus. Madankollu, in-NE C126 l-ieħor, mhuwiex antikorp newtralizzanti, għalkemm jista 'jorbot ma' diversi varjanti ta 'proteini spike ta' tħassib [11]. Minkejja dan, huwa interessanti li l-antikorpi kollha b'reżistenza sħiħa għall-mutazzjonijiet Omicron jimmiraw lejn il-grupp antiġeniku RBD-4.
Mill-antikorpi kollha taħt awtorizzazzjoni għall-użu ta’ emerġenza (EUA), id-database tagħna tissuġġerixxi l-potenzjal ta’ newtralizzazzjoni ta’ Etesevimab (LY-CoVO16)[12], Bamlanivimab (LY-CoV555)[13], Casirivimab (REGN10933), Imdevimab (REGN10987)[14, Cilgavimab (AZD1061). Tixagevimab (AZD8895)[15], Sotrovimab (Vir-7831 jew S309) [8,16], u annimal Reg (CT-P59)[17] jistgħu jitnaqqsu fi gradi differenti minħabba l-mutazzjonijiet estensivi fl-Omicron spike(Figura1F). Minbarra l-istudju rrapporta impatt distint ta 'mutazzjoni waħda fl-RBD, u xi antikorpi kienu influwenzati b'mod drammatiku minn mutazzjoni waħda [18]. Pereżempju, K417N biss idgħajjef l-attività newtralizzanti ta 'Etesevimab, u E484A idgħajjef Bamlanivimab b'mod sinifikanti. In-newtralizzazzjoni indotta minn Imdevimab hija meqruda minn G446S biss [18]. Antikorpi oħra huma influwenzati minn mutazzjonijiet multipli, filwaqt li l-effett kombinatorju ta 'din il-mutazzjoni jista' jiġi stmat biss ibbażat fuq effett ta 'mutazzjoni wieħed. Regdanvimab jista' jittaffef minn K417N, E484A, Q493Rand Y505H f'Omicron flimkien. In-newtralizzazzjoni indotta minn Casirivimab tista' tiġi affettwata minn K417N, E484A, u Q493R f'Omicron kollettivament, għalkemm kull mutazzjoni tbiddel l-antiġeniċità moderatament. S477N, T478K, u E484A jistgħu jinfluwenzaw bi ftit Tixagevimab. Fortunatament, żewġ antikorpi jistgħu jiġu influwenzati biss ftit mill-mutazzjonijiet fil-punt Omicron. Sotrovimab jista’ jiddgħajjef minn G339D u N440K biss. Cilgavimab jista' jiġi affettwat b'mod moderat minn N440K u G446S. Huwa urġenti li jiġu aġġornati l-anti-body-cock-tails terapewtiċi attwali biex jiġġieldu l-varjant Omicron.
4. Diskussjoni
F'dan l-istudju, analizzajna mutazzjonijiet fil-varjant Omicron kontra 132 epitopi ta '120 antikorpi magħrufa. L-analiżi tagħna ssuġġeriet li erbgħa minn kull ħames gruppi antiġeniċi huma affettwati minn mutazzjonijiet Omicron. Erba' antikorpi biss fil-grupp antiġeniku RBD-4 jistgħu jibqgħu reżistenti għal kollox għal mutazzjonijiet fl-ispike Omicron. Peress li l-proteina spike fil-vaċċini kollha tal-lista ta' użu ta' emerġenza (EUL) approvati mid-WHO [19] taqsam bażi strutturali simili/identika biex tinduċi l-antikorpi msemmija hawn fuq, l-analiżi tagħna tissuġġerixxi l-impatt ta 'Omicron fuq antikorpi terapewtiċi attwali mill-Omicron spike. mutazzjonijiet jistgħu japplikaw ukoll għall-kurrentCOVID-19 vaċċini.
L-analiżi tagħna tipprovdi ħarsa ġdida għall-istima tal-ħarba virali meta niffaċċjaw varjant ġdid ta' SARS-CoV-2. Studji tal-passat utilizzaw esperimenti ta' newtralizzazzjoni biex jivvalidaw il-ħarba tal-varjanti. Il-validazzjonijiet sperimentali kienu jeħtieġu ftit ġimgħat biex jinkisbu riżultati preċiżi. Tali dewmien jista’ jkun ta’ detriment għall-pubbliku matul il-pandemija L-analiżi tagħna tista’ toffri tbassir rapidu u preċiż biex jiġi eliminat il-paniku pubbliku. Madankollu, varjanti tal-passat affettwaw biss mutazzjoni vitali waħda jew tnejn fl-ispike, li jillimita fehim profond tal-effett kombinatorju tal-mutazzjonijiet. Fl-analiżi tagħna, huwa diffiċli li tipprovdi analiżi komprensiva tal-effett kombinatorju. Għal stima aktar preċiża, l-effett kombinatorju ta’ mutazzjonijiet multipli għandu jiġi mmudellat fil-futur meta d-dejta rilevanti tkun disponibbli.
L-analiżi tagħna stmat il-bidla antiġenika tal-varjant Omicron. Fid-database tagħna, hemm ħames gruppi antiġeniċi maġġuri fil-proteina spike tas-SARS-CoV-2. Peress li l-mutazzjonijiet fl-Omicron spike laqtu kompletament erba 'gruppi antiġeniċi ewlenin, dan indika li l-antiġeniċità tal-Omicron spike inbidlet b'mod drammatiku meta mqabbla mar-razza oriġinali ta' SARS-CoV-2. Il-VOCs tal-passat b'drift antiġeniku influwenzaw l-iktar żewġ gruppi antiġeniċi [5]. Il-varjanti Alpha u Delta affettwaw RBD-1 u RBD-3 rispettivament, filwaqt li Beta u Gamma affettwaw kemm RBD-1 kif ukoll RBD-2 [5]. Hawnhekk, il-varjant Omicron biddel l-antiġeniċità ta' NTD, RBD-1, RBD-2, u RBD-3 kompletament fl-istess ħin (Figura 1). Ir-riżultat tagħna ssuġġerixxa li l-bidla antiġenika ġġenerata minn mutazzjonijiet Omicron ħolqot proteina spike b'karatteristiċi antiġeniċi kompletament ġodda. Minkejja l-analiżi immedjata tagħna, għandhom isiru aktar esperimenti dettaljati biex jivvalidaw id-drift antiġeniku jew iċ-ċaqliq ta 'Omicron kif ukoll effetti oħra ta' dawk il-mutazzjonijiet.
Is-sejbiet tagħna jistgħu jipprovdu linji gwida rapidi għall-iżvilupp ta 'vaċċini tal-ġenerazzjoni li jmiss u antikorpi terapewtiċi. L-Omicron spike b'mutazzjonijiet multipli juri xebh għoli ma 'dawk fil-polimutant reżistenti għan-newtralizzazzjoni mibni artifiċjalment [20], li dgħajfet b'mod notevoli l-protezzjoni minn vaċċini u infezzjoni tal-passat, u anke tilqim wara l-infezzjoni. Taħt it-theddida ta' Omicron jew varjanti futuri oħra emerġenti, l-iżvilupp ta' vaċċini tal-ġenerazzjoni li jmiss jew terapiji bbażati fuq antikorpi kontra SARS-CoV-2għandu jqis risponsi umorali effettivi b'attivitajiet newtralizzanti wesgħin kontra SARS-CoV{{9 }} varjanti bbażati fuq traċċar aġġornat tal-evoluzzjoni virali. L-analiżi tagħna wriet l-antikorpi kollha b'reżistenza sħiħa għall-mutazzjonijiet fl-RBD tal-mira tal-ispike Omicron-4imma l-ebda antikorpi taħt RBD mira tal-EUA-4(Figura 1E). Fil-futur, b'koktejls ta' antikorpi terapewtiċi, huwa aħjar li tuża antikorpi multipli kontra kull grupp antiġeniku ewlieni biex jitnaqqas ir-riskju ta 'ħarba virali minħabba mutazzjonijiet multipli.
B'mod importanti, huwa kritiku li jitneħħa antikorpi terapewtiċi jew protettivi oħra li jimmiraw antiġeni oħra għajr il-proteina spike tas-SARS-CoV-2. Anke għall-proteina spike, il-biċċa l-kbira tar-riċerkaturi jiffokaw fuq id-dominju RBD biss. Fid-database tagħna (Tabella S1), aktar minn nofs l-antikorpi (69minn 120) sempliċement jimmiraw lejn il-grupp antiġeniku RBD-1 jew RBD-2. L-iffukar żejjed ta 'antikorpi li jimmiraw il-proteina spike jew l-RBD fil-passat jista' jwassal għall-ħarba virali ta 'Omicron fil-preżent. Huwa possibbli li l-pressjoni tal-evoluzzjoni fuq il-proteina spike tirriżulta fl-okkorrenza tal-varjant Omicron fi żmien sena wara tilqim fuq skala kbira f'diversi pajjiżi. Huwa aħjar li tingħata aktar attenzjoni għal antiġeni oħra, bħal nucleocapsid jew antiġeni minn frames oħra ta 'qari miftuħ, fil-futur. Antikorpi multipli li jimmiraw antiġeni multipli jistgħu jimminimizzaw iċ-ċaqliq antiġeniku potenzjali jew id-drift f'varjanti emerġenti ta' SARS-CoV-2.
Barra minn hekk, l-immunità protettiva miċ-ċelluli T m'għandhiex tiġi injorata, peress li evidenza minn ħaddiema tal-kura tas-saħħa [21] u vaċċini taċ-ċelluli T [22] tissuġġerixxi li l-epitopi taċ-ċelluli T huma wkoll miri promettenti biex jinduċu rispons immuni kontra SARS-CoV-2 . L-epitopi taċ-ċelluli T ġew injorati fl-iżvilupp ta 'vaċċini kontra mard infettiv għal żmien twil. F'dawn l-aħħar snin, l-epitopi taċ-ċelluli T ġew utilizzati fil-vaċċini tal-kanċer u wrew effikaċja promettenti fi prova klinika fi stadju bikri [23]. Peress li l-epitopi taċ-ċelluli T huma rikonoxxuti mingħajr konformazzjoni nattiva fl-antiġeni oriġinali, il-vaċċini bbażati fuq l-epitopi taċ-ċelluli T jistgħu joffru saffi addizzjonali ta 'protezzjoni kontra l-ħarba virali [21]. Fil-futur, huwa aħjar li jiġu żviluppati vaċċini li jipprovokaw kemm iċ-ċelluli B kif ukoll iċ-ċelluli T immunità biex tipproteġi kontra ċaqliq antiġeniku jew drift ta' varjanti emerġenti.
Bħala konklużjoni, l-analiżi tagħna malajr stmat l-impatt tal-mutazzjoni Omicron fuq 120 antikorpi. Il-mutazzjonijiet Omicron affettwaw erbgħa minn kull ħames gruppi antiġeniċi ewlenin fl-ispike. Is-sejbiet tagħna wrew ukoll li erba' antikorpi jistgħu jibqgħu effettivi kontra l-varjant Omicron SARS.CoV-2. Eventwalment, l-istudju tagħna jista 'jiggwida l-monitoraġġ futur tal-evoluzzjoni antiġenika varjant u l-iżvilupp ta' vaċċini tal-ġenerazzjoni li jmiss u antikorpi terapewtiċi.
kostanche
Referenzi
1. Organizzazzjoni Dinjija tas-Saħħa. It-traċċar ta' Varjanti ta' SARS-CoV-2.
2. Tsang, AKL; Cheng, PKC; Mak, GCK; Leung, PKL; Yip, PCW; Lam, ETK; Ng, KHL; Chan, RCW Numru għoli mhux tas-soltu ta' mutazzjonijiet tal-proteini ta' spike għar-razez tas-SARS-CoV-2 misjuba f'Hong Kong. J. Clin. Virol. 2022, 20, 105081.
3. Organizzazzjoni Dinjija tas-Saħħa. Klassifikazzjoni ta' Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Varjant ta' Tħassib.
4. Tong, P.; Gautam, A.; Windsor, IW; Travers, M.; Chen, Y.; Garcia, N.; Whiteman, NB; McKay, LGA; Maltempata, N.; Wesemann, DR; et al. Repertorju taċ-ċelluli B tal-memorja għar-rikonoxximent ta 'spike SARS-CoV-2 li qed jevolvi. Ċellula 2021, 184, 4969–4980.e15.
5. Greaney, AJ; Starr, TN; Barnes, CO; Weisblum, Y.; Schmidt, F.; Caskey, M.; Gaebler, C.; Hatziioannou, T.; Bieniasz, PD; Bloom, JD; et al. Immappjar ta' Mutazzjonijiet għas-SARS-CoV-2 RBD Li Jaħarbu L-Irbit minn Klassijiet Differenti ta' Antikorpi. Nat.Commun. 2021, 12, 4196. https://doi.org/10.1038/s41467-021-24435-8.
6. Ponomarenko, J.; Papangelopoulos, N.; Zajonc, DM; Peters, B.; Sette, A.; Bourne, PE IEDB-3D: Dejta strutturali fi ħdan id-database tal-epitopi immuni. Aċidi Nukleiċi Res. 2011, 39, D1164–D1170.
7. Dejnirattisai, W.; Zhou, D.; Supasa, P.; Liu, C.; Mentzer, AJ; Ginn, HM; Zhao, Y.; Duyvesteyn, HM; Tuekprakhon, A.; Nutella, R.; et al. Evażjoni ta' antikorpi mir-razza P.1 ta' SARS-CoV-2. Ċellula 2021, 184, 2939–2954.e9.
8. Pinto, D.; Park, YJ; Beltramello, M.; Ħitan, AC; Tortorici, MA; Bianchi, S.; Jaconi, S.; Culap, K.; Zatta, F.; Corti, D.; et al. Inkronewtralizzazzjoni ta' SARS-CoV-2 minn antikorp uman monoklonali SARS-CoV. Natura 2020, 583, 290–295.
9. Chen, RE; Zhang, X.; Kawża, JB; Winkler, ES; Liu, Y.; VanBlargan, LA; Liu, J.; Errico, JM; Xie, X.; Djamant, MS; et al. Reżistenza ta' varjanti ta' SARS-CoV-2 għan-newtralizzazzjoni minn antikorpi monoklonali u poliklonali derivati mis-serum. Nat. Med. 2021, 27, 717–726.
10. Starr, TN; Czudnochowski, N.; Liu, Z.; Zatta, F.; Park, YJ; Addetia, A.; Pinto, D.; Beltramello, M.; Hernandez, P.; Snell, G.; et al. Antikorpi SARS-CoV-2 RBD li jimmassimizzaw il-wisa' u r-reżistenza għall-ħarba. Natura 2021, 597, 97–102.
11. Chen, KE; Gilchuk, P.; Zost, SJ; Suryadevara, N.; Winkler, ES; Cabel, CR; Bernstein, E.; Chen, RE; Sutton, RE; Crowe Jr, JE; et al. Reazzjonijiet ta' antikorpi konverġenti għall-proteina spike tas-SARS-CoV-2 f'individwi konvalexxenti u mlaqqma. Cell Rep.2021, 36, 109604.
12. Starr, TN; Greaney, AJ; Dingens, AS; Bloom, JD Mappa kompluta ta' mutazzjonijiet SARS-CoV-2 RBD li jaħarbu mill-antikorp monoklonali LY-CoV555 u l-cocktail tiegħu ma' LY-CoV016. Ċellula Rep Med. 2021, 2, 100255.
13. Jones, BE; Brown-Augsburger, PL; Corbett, KS; Westendorf, K.; Davies, J.; Cujec, TP; Wiethoff, CM; Blackbourne, JL; Heinz, BA; Foster, D.; et al. L-antikorp newtralizzanti, LY-CoV555, jipproteġi kontra l-infezzjoni SARS-CoV-2 fil-primati mhux umani. Sci. Transl. Med. 2021, 13, eabf1906.
14. Hansen, J.; Baum, A.; Pascal, KE; Russo, V.; Giordano, S.; Wloga, E.; Fulton, BO; Yan, Y.; Koon, K.; Patel, K.; et al. Studji fuq ġrieden umanizzati u bnedmin konvalexxenti jagħtu cocktail ta' antikorpi SARS-CoV-2. Xjenza 2020, 369, 1010–1014.
15. Dong, J.; Zost, SJ; Greaney, AJ; Starr, TN; Dingens, AS; Chen, KE; Chen, RE; Kawża, JB; Sutton, RE; Gilchuk, P.; et al. Bażi ġenetika u strutturali għan-newtralizzazzjoni tal-varjanti ta' SARS-CoV-2 permezz ta' cocktail ta' żewġ antikorpi. Nat. Microbiol. 2021, 6, 1233–1244.
16. Piccoli, L.; Park, Y.-J.; Tortorici, MA; Czudnochowski, N.; Ħitan, AC; Beltramello, M.; Silacci-Fregni, C.; Pinto, D.; Rosen, LE; Bowen, JE; et al. Immappjar ta' Siti Newtralizzanti u Immunodominanti fuq is-SARS-CoV-2 Spike Receptor Binding Domain bis-Seroloġija ta' Riżoluzzjoni Għolja Ggwidata mill-Istrutturi. Ċellula 2020, 183, 1024–1042.e21.
17. Kim, C.; Ryu, D.-K.; Lee, J.; Kim, Y.-I.; Seo, J.-M.; Kim, Y.-G.; Jeong, J.-H.; Kim, M.; Kim, J.-I.; Kim, P.; et al. Antikorp newtralizzanti terapewtiku li jimmira lid-dominju tal-irbit tar-riċettur tal-proteina spike tas-SARS-CoV-2. Nat. Komun. 2021, 12, 288.
18. Greaney, AJ; Starr, TN; Gilchuk, P.; Zost, SJ; Bernstein, E.; Loes, AN; Hilton, SK; Huddleston, J.; Eguia, R.; Crawford, KH; et al. Immappjar komplut ta' Mutazzjonijiet għad-Dominju tal-Irbit tar-Riċetturi Spike tas-SARS-CoV-2 li jaħrab mir-Rikonoxximent tal-Antikorpi. Cell Host Microbe 2021, 29, 44–57.e9.
19. Organizzazzjoni Dinjija tas-Saħħa. Status ta' Vaċċini COVID-19 fi ħdan il-Proċess ta' Evalwazzjoni WHO EUL/PQ. Disponibbli onlajn:
20. Schmidt, F.; Weisblum, Y.; Rutkowska, M.; Poston, D.; Da Silva, J.; Zhang, F.; Bednarski, E.; Cho, A.; Schaefer-Babajew, DJ; Gaebler, C.; et al. Ostaklu ġenetiku għoli għall-ħarba ta' antikorp newtralizzanti poliklonali tas-SARS-CoV-2. Natura 2021, 600, 512–516.
21. Swadling, L.; Diniz, MO; Schmidt, NM; Amin, OE; Chandran, A.; Shaw, E.; Pade, C.; Gibbons, JM; Le Bert, N.; Tan, AT; et al. Ċelloli T speċifiċi għall-polimerażi pre-eżistenti jespandu f'SARS-CoV seronegattiv abortiv-2. Natura 2022, 601, 110–117.
22. Heitmann, JS; Bilich, T.; Tandler, C.; Nelde, A.; Mariner, Y.; Marconato, M.; Reusch, J.; Jäger, S.; Denk, M.; Richter, M.; et al. Vaċċin tal-peptide COVID-19 għall-induzzjoni tal-immunità taċ-ċelluli T SARS-CoV-2. Natura 2021, 601, 617–622.
23. Ott, PA; Hu-Lieskovan, S.; Chmielowski, B.; Govindan, R.; Naing, A.; Bhardwaj, N.; Margolin, K.; Awad, MM; Hellmann, MD; Lin, JJ; et al. Prova ta' Fażi Ib ta' Terapija Neoantigen Personalizzata Plus Anti-PD-1 f'Pazjenti b'Melanoma Avvanzata,
Kanċer tal-Pulmun taċ-Ċelloli Mhux Żgħar, jew Kanċer tal-Bużżieqa tal-Awrina. Ċellula 2020, 183, 347–362.e24.
