Astratt

Il-marda ta' Parkinson (PD) tirrappreżenta disturb progressiv tal-moviment newrodeġenerattiv li m'għandux terapiji kurattivi radikali. Il-par erbali li jikkonsisti minnCistanche deserticolauAngelica sinensishija kombinazzjoni magħrufa sew tal-mediċina tradizzjonali Ċiniża (TCM) irrappurtata li ttaffi s-sintomi kliniċi assoċjati mal-PD. Din ir-riċerka integrata l-fluss tax-xogħol tan-netwerk-farmakoloġija u l-mudell ta 'tbassir ta' tagħlim profond biex tikxef miri terapewtiċi kandidati u mekkaniżmi molekulari latenti ta 'dan il-par erbali kontra l-PD.

Kostitwenti kimiċi attivi ta'Cistanche deserticola-Angelica sinensisġew irkuprati u ffiltrati permezz tad-database TCMSP. Id-database PubChem ipprovdiet informazzjoni strutturali komposta. L-analiżi tal-intersezzjoni identifikat 131 ġene kondiviż bejn miri relatati mad-droga u ġeni assoċjati mal-marda tal-PD. L-arrikkiment funzjonali GO u l-arrikkiment tal-mogħdija KEGG saru għal dawn il-ġeni li jikkoinċidu. Il-mudell CNN_CNN_BindingDB mħarreġ minn qabel inkorporat fis-sett ta' għodda ta' tagħlim profond DeepPurpose ġie skjerat biex ibassar b'mod kwantitattiv l-affinità tal-irbit tal-proteini molekulari bejn il-fitokimiċi rappreżentattivi u l-proteini fil-mira tal-hub.

L-outputs ta’ arrikkiment funzjonali wrew li din it-taħlita veġetali tintervjeni l-progressjoni patoloġika tal-PD permezz ta’ reazzjonijiet bijoloġiċi inklużi reazzjoni ta’ stimolu eżoġenu, mogħdijiet relatati mal-infezzjoni, rispons ta’ lipopolisakkaridi u rispons ta’ stress ta’ speċi ta’ ossiġenu reattiv. Il-mogħdijiet ta' sinjalar KEGG dominanti koprew mogħdija ta' attivazzjoni tar-riċettur-kimika-karċinoġenesi kif ukoll kaskata ta' sinjalazzjoni AGE-RAGE. Tbassir ta' affinità ta' tagħlim profond ivverifikat interazzjoni ta' rabta robusta bejn ingredjenti bijoattivi ewlenin (-sitosterol, quercetin, arachidonate u fitokimiċi oħra) u proteini ewlenin relatati mal-PD (HIF1A, TP53, MYC, MAPK1, HSP90AA1, FOS, EGFR, RELAND, STAT1KT1, STAT1KT1).

Kollettivament,Cistanche deserticola-Angelica sinensispar veġetali jeżerċita effetti farmakoloġiċi b'ħafna komponenti u multi-mira għall-intervent tal-PD. Is-sustanzi attivi tiegħu jimmodulaw l-awtofaġija, l-apoptożi ċellulari, l-omeostażi tal-istress ossidattiv u r-risponsi newroinfjammatorji. Dan l-istudju komputazzjonali jipprovdi evidenza teoretika preliminari u riżors ta' referenza għal validazzjoni sperimentali sussegwenti u screening tad-droga kontra l-PD derivati ​​minn kombinazzjonijiet ta' ħxejjex TCM.

Kliem ewlieni: Il-marda ta' Parkinson; farmakoloġija tan-netwerk; tagħlim profond;Cistanche deserticola; Angelica sinensis; par erbali; newroprotezzjoni; tbassir tal-mira

1. Introduzzjoni

Il-marda ta 'Parkinson (PD) hija diżordni newrodeġenerattiva kronika li diżabilita kkaratterizzata minn deġenerazzjoni progressiva ta' newroni dopaminerġiċi nigrostriatal. Manifestazzjonijiet kliniċi tipiċi jinkludu rogħda ta’ mistrieħ, riġidità muskolari, instabbiltà posturali, bradikinesja, akkumpanjati minn sintomi mhux motorji bħal disturbi fl-irqad, disfunzjoni tax-xamm, stitikezza u indeboliment konjittiv mentali. L-amministrazzjoni fit-tul ta' levodopa ta' spiss tiġġenera reazzjonijiet avversi ta' kumplikazzjoni tal-muturi. Għalhekk, l-iskoperta u l-iżvilupp ta 'aġenti terapewtiċi newroprotettivi ġodda jibqgħu talbiet kliniċi urġenti.

Il-mediċina tal-ħxejjex tradizzjonali Ċiniża tipprovdi riżorsi kandidati abbundanti għall-esplorazzjoni tad-droga tal-mard newrodeġenerattiv.Cistanche deserticola(Rou-cong-rong) uAngelica sinensis(Dang-gui) huma ħwawar mediċinali kkombinati ta' spiss fi ħdan il-prattika klinika tat-TCM. Investigazzjonijiet farmakoloġiċi moderni vvalidaw bijofunzjonijiet multipli għal dawn iż-żewġ materjali erbali.Cistanche deserticola, il-"ġinseng tad-deżert", jippossjedi attivitajiet protettivi tan-newroni, immunomodulatorji, kontra t-tumur u ta' regolazzjoni gastrointestinali bi profili ta' bijosikurezza favorevoli PMC. Il-komponenti tal-phenylethanoid-glycoside tiegħu bħal echinacoside u verbascoside jistgħu jtaffu l-ħsara newronali ossidattiva, jinibixxu l-apoptożi tan-newroni dopaminerġiċi u jirregolaw il-fluss tal-awtofaġija, li juru effetti promettenti ta 'qabel il-PD kontra l-PD.Angelica sinensishuwa applikat b'mod wiesa 'għall-nutrizzjoni tad-demm u biex jattiva ċ-ċirkolazzjoni tad-demm fil-preskrizzjonijiet tat-TCM; l-estratti tiegħu juru prestazzjoni anti-infjammatorja, kapaċità ta' tneħħija ta' speċi ta' ossiġenu reattiv, proprjetajiet kontra t-tixjiħ u newrotrofiċi Fruntieri. L-użu magħqud ta' dawn iż-żewġ ħxejjex huwa preżunt li jiġġenera benefiċċji newroprotettivi sinerġistiċi għal pazjenti b'PD.

Madankollu, il-mekkaniżmu molekulari olistiku sottostanti l-Cistanche deserticola-Angelica sinensispar veġetali li jikkura l-marda ta' Parkinson għadu mhux iċċarat biżżejjed minn esperimenti konvenzjonali tal-laboratorju b'mira waħda. Il-metodoloġija tan-netwerk tal-farmakoloġija tissimula l-karatteristika ta' "multi-kompost, multi-mira, multi-path" tal-formuli TCM, li taqbel perfettament għad-deċiframent tal-mekkaniżmu ta' kombinazzjonijiet ta' ħxejjex. Barra minn hekk, it-tbassir tal-affinità tal-irbit tal-mira tad-droga bbażata fuq it-tagħlim fil-fond ikompli jissupplimenta l-fluss tax-xogħol tad-docking molekulari tradizzjonali u jtejjeb l-effiċjenza tal-iskrinjar b'rendiment għoli għall-interazzjoni tal-mira kompost. Il-librerija open-source DeepPurpose tipprovdi arkitetturi multipli ta' netwerk newrali mħarrġa minn qabel għat-tbassir tal-interazzjoni fil-mira tad-droga; il-mudell CNN_CNN_BindingDB jikseb prestazzjoni affidabbli għall-istima tal-punteġġ tal-irbit tal-proteini ta' molekuli żgħar.

F'dan l-istudju komputazzjonali, integrajna pipeline analitiku tan-netwerk-farmakoloġija mal-mudell ta' tagħlim profond DeepPurpose biex nisondaw b'mod sistematiku miri potenzjali u kaskati ta' sinjalar modulati minnCistanche deserticola-Angelica sinensiskontra l-PD. Għandna l-għan li niżvelaw mekkaniżmu molekulari sinerġistiku ta’ dan il-par erbali u nibdew bażi teoretika għal analiżi ċellulari ta’ segwitu in vitro u verifika ta’ mudell ta’ annimali in vivo, li naċċelleraw l-isfruttament ta’ mediċini kandidati ġodda għat-terapija tal-marda ta’ Parkinson.

2. Materjali u Metodi

2.1 Irkupru tas-sett tad-dejta u screening tal-mira kompost

Komponenti kimiċi bijoattivi ta 'Cistanche deserticolauAngelica sinensisnkisbu minn TCMSP (Pjattaforma ta' Database u Analiżi ta' Sistemi ta' Mediċina Ċiniża Tradizzjonali). Ġew applikati tliet kriterji ta' filtru għall-iskrinjar tal-komposti kandidati: bijodisponibilità orali OB Akbar minn jew ugwali għal 30 %; DL li jixbhu lill-mediċina Akbar minn jew ugwali għal 0.18; permeabilità tal-barriera tad-demm-moħħ BBB Akbar minn jew ugwali għal -0.85. L-issettjar tal-limitu BBB jiggarantixxi li l-fitokimiċi skrinjati għandhom kapaċità teoretika li jaqsmu l-barriera tad-demm-moħħ u jaġixxu fuq leżjonijiet tas-sistema nervuża ċentrali relatati mal-patoloġija tal-PD, meta jitqies l-indeboliment tal-barriera tad-demm-moħħ li jseħħ ta’ spiss fost pazjenti b’PD.

Id-database PubChem ġiet mistoqsija għal kordi strutturali SMILES kanoniċi ta 'komposti ffiltrati. Ġeni fil-mira assoċjati mal-mard għall-marda ta 'Parkinson inġabru minn databases GeneCards, OMIM, PharmGkb, TTD u DrugBank. Wara li kkonsolidaw u dduplikaw l-entrati tal-ġeni relatati mal-mard, saret analiżi tal-intersezzjoni bejn miri mbassra ta' komposti erbali u ġeni ta' mard rilevanti għall-PD biex jinkisbu ġeni ta' mira kondiviżi li jikkoinċidu tal-par erbali għat-trattament tal-PD.

2.2 Kostruzzjoni ta' netwerk ta' interazzjoni proteina-proteina (PPI).

Ġeni fil-mira komuni li jikkoinċidu ġew sottomessi għad-database STRING. Speċi kienet speċifikata bħalaHomo sapiens, confidence threshold was set to highest‑confidence score >0.9; parametri oħra miżmuma bħala konfigurazzjoni default biex jinbena netwerk ta' interazzjoni proteina-proteina. Ġew ikkalkolati l-parametri topoloġiċi tan-netwerk inklużi l-grad-ċentralità (DC), iċ-ċentralità-bejn (BC), iċ-ċentralità-qrubija (CC), iċ-ċentralità-vector-eigen (EC). Il-plugin CytoNCA fi ħdan is-software Cytoscape wettaq filtrazzjoni tal-ġeni tal-hub darbtejn dawra biex jidentifika l-ġeni ewlenin tal-mira tal-hub. L-ewwel kriterji ta' filtrazzjoni: BC akbar minn jew ugwali għal 49.43, CC akbar minn jew ugwali għal 0.15, DC akbar minn jew ugwali għal 5.0, EC akbar minn jew ugwali għal 0.05. Iffiltrar aktar strett tat-tieni rawnd: BC akbar minn jew ugwali għal 15.43, CC akbar minn jew ugwali għal 0.54, DC akbar minn jew ugwali għal 8, EC akbar minn jew ugwali għal 0.14. Ġeni li jissodisfaw il-limiti ta 'screening sekondarju ġew definiti bħala miri ċentrali ta' dan il-par erbali kontra l-PD.

2.3 Analiżi ta' arrikkiment GO u KEGG

Pjattaforma R-studio b'pakketti tal-ekosistema Bioconductor (clusterProfiler, ggplot2 u pakketti ta' dipendenza awżiljarja) ġiet adottata għall-analiżi tal-arrikkiment funzjonali tal-Gene-Ontology (GO) u l-analiżi tal-arrikkiment tal-mogħdija ta' Kyoto-Encyclopedia-of-Genes-and-Genomes (KEGG) għal 131 mira li jaqsmu bejniethom. L-analiżi tal-arrikkiment GO tkopri tliet kategoriji: proċess bijoloġiku (BP), komponent ċellulari (CC), funzjoni molekulari (MF). Valur P< 0.05 was regarded as statistically‑significant enrichment threshold.

2.4 Tbassir tal-affinità tal-irbit ibbażat fuq it-tagħlim profond

Is-sett ta' għodod DeepPurpose open-source ta' tagħlim profond intuża għat-tbassir tal-affinità tal-irbit tad-droga. Intgħażel mudell CNN_CNN_BindingDB imħarreġ minn qabel għall-kalkolu. Sekwenzi amino-aċidi tal-proteini fil-mira tal-qalba ġew imniżżla mid-database UniProt; kordi SMILES komposti ġew irkuprati mid-database PubChem. Dan il-mudell ibridu ta' netwerk newrali konvoluzzjonali jieħu s-sekwenza SMILES komposta u s-sekwenza ta' amino-aċidi tal-proteini fil-mira bħala karatteristiċi ta' input doppju u joħroġ matriċi ta' punteġġ ta' qawwa ta' rbit kwantitattiv għal pari ta' mira komposti. Il-viżwalizzazzjoni tal-matriċi tat-tbassir tal-irbit ġiet implimentata biex turi l-intensità tal-interazzjoni bejn il-fitokimiċi rappreżentattivi tal-pari erbali u l-proteini relatati mal-PD taċ-ċentru.

3. Riżultati

3.1 Komposti attivi u ġbir ta' mira tad-droga

Wara l-irkupru tad-database TCMSP u l-kriterji ta’ filtrazzjoni tridimensjonali (OB akbar minn jew ugwali għal 30 %, DL akbar minn jew ugwali għal 0.18, BBB akbar minn jew ugwali għal -0.85), inkisbu seba’ fitokimiċi bijoattivi (inkluż kostitwent komuni komuni għaż-żewġ ħxejjex aromatiċi)Cistanche deserticola-Angelica sinensispar erbali. L-iscript Strawberry-Perl wettaq konverżjoni tal-ID tal-mira, id-database UniProt annotata u ismijiet tal-ġeni standardizzati; fl-aħħar inkisbu total ta' 297 ġeni putattiv fil-mira tad-droga marbuta mal-komposti tal-pari erbali.

3.2 Screening ta' intersezzjoni għal miri terapewtiċi rilevanti għall-PD

Id-databases tal-ġeni tal-mard multipli (GeneCards, OMIM, PharmGkb, TTD, DrugBank) ġew integrati u deduplikati, u wasslu għal 11 208 ġeni tal-mard relatati mal-PD totali. Kalkolu ta' intersezzjoni bejn sett ta' mira ta' par ta' ħxejjex u sett ta' dejta tal-ġeni tal-marda tal-PD prodott131 ġeni komuni li jintersetaw, li kien jikkostitwixxi grupp ta' mira terapewtika potenzjali li jimmedja azzjonijiet farmakoloġiċi kontra l-PD għalCistanche deserticola-Angelica sinensis.

3.3 Identifikazzjoni tal-mira tal-hub ewlieni min-netwerk tal-PPI

Il-131 mira kondiviża ġew importati f'STRING biex jinbena netwerk ta' interazzjoni proteini-proteini. L-iffiltrar tal-parametri topoloġiċi f'żewġ stadji permezz tal-plugin CytoNCA skrinja ħdax-il ġene ċentrali tal-hub:HIF1A, TP53, MYC, MAPK1, HSP90AA1, FOS, EGFR, RELA, STAT1, CCND1, AKT1. Dawn il-ġeni hub jokkupaw status regolatorju ċentrali fi ħdan in-netwerk bijoloġiku u huma spekulati li jservu bħala nodi ta 'azzjoni primarja għal dan il-par erbali li jinterferixxi l-progressjoni patoloġika tal-PD.

3.4 Arrikkiment funzjonali GO u riżultati ta' arrikkiment tal-mogħdija KEGG

Ir-riżultati tal-arrikkiment tal-GO wrew li dawn il-miri kondiviżi jipparteċipaw f'reazzjonijiet multipli ta 'proċess bijoloġiku: rispons ta' stimolu eżoġenu, reazzjoni assoċjata mal-infezzjoni, rispons infjammatorju medjat minn lipopolisakkaridi, rispons metaboliku tal-ispeċi tal-ossiġenu reattiv. Fil-livell ta' funzjoni molekulari, il-proteini taċ-ċentru jeżerċitaw attività ta' rabta tal-fattur ta' traskrizzjoni li torbot id-DNA, funzjoni ta' rabta tal-ligase tal-proteina simili ubiquitin u attività li tirregola r-riċettur nukleari. Postijiet korrispondenti tal-komponenti ċellulari jinvolvu mikrodominji tal-membrana tal-plażma, ċattri tal-membrana u lumens tal-granuli intraċellulari.

L-analiżi tal-arrikkiment tal-mogħdija KEGG uriet kaskati ta’ sinjalar arrikkit b’mod sinifikanti, fosthom il-mogħdija ta’ attivazzjoni tar-riċetturi tal-karċinoġenesi kimika u l-mogħdija tas-sinjalar AGE-RAGE huma mogħdijiet rappreżentattivi ta’ rilevanza għolja. Kaskati sinifikanti oħra jinkludu sinjalar PI3K-Akt, sinjalar MAPK, mogħdija ta 'rispons infjammatorju IL-17 u mogħdija ta' infjammazzjoni medjata minn TNF, li huma assoċjati sewwa ma 'stress ossidattiv newronali, newroinfjammazzjoni, apoptosi taċ-ċelluli u avvenimenti regolatorji tal-awtofaġija matul il-patoġenesi tal-PD.

3.5 Tbassir tal-affinità tal-irbit CNN_CNN_BindingDB ta' tagħlim profond

Il-mudell DeepPurpose CNN_CNN_BindingDB mbassar is-saħħa tal-interazzjoni tal-irbit bejn il-fitokimiċi rappreżentattivi (yangambin, suchilactone, stigmasterol, quercetin, marckine, -sitosterol, arachidonate) u ħdax-il proteina tal-mira tal-hub tal-qalba. Il-matriċi tal-mappa tas-sħana tal-punteġġ tal-irbit wriet li komposti multipli inklużi -sitosterol, quercetin, marckine u arachidonate urew affinità qawwija ta' rbit mal-biċċa l-kbira tan-nodi tal-mira hub bħal AKT1, TP53, MYC, MAPK1, FOS, HIF1A u STAT1. Dan ir-riżultat komputazzjonali ta' tagħlim profond jappoġġja l-ipoteżi li l-komponenti attivi joriġinaw minnCistanche deserticola-Angelica sinensispar veġetali jistgħu jinteraġixxu direttament mal-proteini ewlenin assoċjati mal-PD u jimmodulaw il-funzjoni bijoloġika tagħhom.

4. Diskussjoni

Il-patoġenesi tal-marda ta 'Parkinson tinvolvi crosstalk ikkumplikat fost korriment mill-istress ossidattiv, newroinfjammazzjoni, aggregazzjoni ta' proteini, disfunzjoni mitokondrijali, awtofaġija disregolata u apoptosi tan-newroni dopaminerġiċi. Il-monoterapija b'molekula waħda hija diffiċli biex treġġa' lura l-ħsara newrodeġenerattiva mmexxija minn diversi fatturi. TCM par erbaliCistanche deserticola-Angelica sinensisjaħdem permezz ta' mod sinerġistiku b'ħafna komponenti, li tqabbel il-karatteristika ta' karatteristika multi-patoloġika tal-PD. Dan l-istudju għaqqad il-farmakoloġija tan-netwerk u t-tbassir tal-irbit tal-mira ta' tagħlim profond biex jiddissezzjona l-mekkaniżmu molekulari potenzjali tiegħu kontra l-PD.

Ġew skrinjati seba' fitokimiċi bijoattivi kwalifikati, inklużi -sitosterol, quercetin, arachidonate, stigmasterol u prodotti naturali newroprotettivi oħra dokumentati tajjeb. Total ta' 131 ġeni li jikkoinċidu bejn miri veġetali u ġeni tal-marda tal-PD indikaw ambitu wiesa' ta' intervent ta' dan il-par erbali għan-netwerk patoloġiku tal-PD. Ħdax-il ġene hub (HIF1A, TP53, MYC, MAPK1, HSP90AA1, FOS, EGFR, RELA, STAT1, CCND1, AKT1) ġew iffiltrati min-netwerk PPI. Dawn il-ġeni taċ-ċentru huma regolaturi ċentrali għas-sopravivenza taċ-ċelluli, l-infjammazzjoni u r-rispons għall-istress ossidattiv. AKT1 jappartjeni għan-nodu ewlieni tal-mogħdija tas-sinjalar PI3K-AKT; l-istatus ta 'fosforilazzjoni tiegħu jikkontrolla l-apoptosi taċ-ċelluli u l-proċess ta' awtofaġija fin-newroni dopaminerġiċi. TP53 jimmedja l-apoptosi newronali kkawżata minn ħsara fid-DNA; MAPK1 jipparteċipa f'kaskata tal-protein-kinase attivata mill-mitoġenu attivata mill-istress li tiffaċilita l-mewt tan-newroni taħt kundizzjoni ta' stress ossidattiv. HIF1A jimmodula reazzjoni ipossika-infjammatorja fil-mikroambjent tas-sistema nervuża ċentrali. RELA u STAT1 huma molekuli ewlenin tal-fattur tat-traskrizzjoni għat-trasduzzjoni tas-sinjal newroinfjammatorju mmexxija minn NF-κB.

L-analiżi tal-arrikkiment tal-KEGG enfasizzat il-mogħdija tas-sinjalar AGE-RAGE bħala mogħdija arrikkita kritika. Attivazzjoni anormali tal-assi AGE-RAGE tista 'tqajjem rilaxx ta' fattur infjammatorju dipendenti fuq NF-κB, taggrava l-piż tal-istress ossidattiv ta 'newroni substantia-nigra u taċċellera l-progressjoni tal-PD, li hija konsistenti mar-riċerka dwar il-mekkaniżmu ta' newrodeġenerazzjoni ppubblikata preċedentement 甘肃中医药. Il-mogħdija PI3K-Akt huma wkoll arrikkita b'mod sinifikanti. L-ingredjenti tal-pari veġetali jistgħu jrażżnu l-attivazzjoni żejda tal-mikroglia u t-tnixxija ta' ċitokini pro-infjammatorji (TNF-, IL-17 eċċ.), inaqqsu l-ħsara tan-newroni medjata minn infjammazzjoni. L-arrikkiment tal-proċess bijoloġiku GO wera arrikkiment prominenti għar-rispons tal-ispeċi tal-ossiġenu reattiv, li jindika effett antiossidant jikkostitwixxi mekkaniżmu newroprotettiv vitali ta 'dan il-par erbali.

Differenti minn simulazzjoni ta' docking molekulari konvenzjonali, applikajna l-mudell ta' tagħlim profond DeepPurpose CNN_CNN_BindingDB biex nevalwaw l-affinità ta' rbit ta' mira kompost. Il-mudell tan-netwerk tan-newrali konvoluzzjonali jitgħallem data ta' rbit sperimentali massiva mid-database BindingDB, li tipprovdi tbassir kwantitattiv b'rendiment għoli għall-interazzjoni bejn molekuli żgħar tal-ħxejjex u proteini fil-mira. Il-matriċi tal-mappa tas-sħana tat-tbassir wriet li -sitosterol, quercetin u arachidonate għandhom potenzjal ta’ rbit eċċellenti kontra l-biċċa l-kbira tal-proteini taċ-ċentru, li jissuġġerixxi li dawn il-kostitwenti jistgħu jservu bħala molekuli effetturi ewlenin għall-attività kontra l-PD ta’Cistanche deserticola-Angelica sinensis.

Din ir-riċerka komputazzjonali għad għandha limitazzjonijiet inerenti. Il-konklużjonijiet kollha huma derivati ​​minn tbassir in-silico; esperimenti ulterjuri fil-livell ċellulari u validazzjoni tal-mudell tal-annimali PD huma indispensabbli biex jiġu vverifikati l-interazzjoni tal-mira kompost u l-effetti li jirregolaw il-mogħdija. Barra minn hekk, il-kriterji ta 'screening tagħna ffissaw parametri OB, DL u BBB; xi kostitwenti ta' bijodisponibilità baxxa jistgħu jiġu ffiltrati, filwaqt li prodotti ta' trasformazzjoni metabolika wara amministrazzjoni orali tal-ħxejjex ma ġewx ikkunsidrati. Xogħol sussegwenti għandu jintegra l-farmakokimika fis-serum biex jidentifika l-komposti prototipi u l-metaboliti attwali li jippenetraw il-barriera tad-demm-moħħ u l-metaboliti derivati ​​mill-amministrazzjoni orali ta’ par ta’ ħxejjex.

Mill-perspettiva tal-applikazzjoni translazzjonali, dan l-istudju jipprovdi lista ta’ komposti ta’ kandidati u sett ta’ mira ċentrali, li jappoġġa screening ta’ segwitu ta’ mediċini ġodda, ottimizzazzjoni ta’ formulazzjoni ta’ estratti veġetali għal terapija komplementari tal-PD.

5. Konklużjoni

Fil-qosor, dan l-istudju adotta farmakoloġija tan-netwerk flimkien ma’ fluss tax-xogħol ta’ tbassir ta’ tagħlim fil-fond biex jinvestiga sistematikament mekkaniżmu terapewtiku potenzjali għalCistanche deserticola-Angelica sinensispar erbali kontra l-marda ta 'Parkinson.

Inkisbu total ta' seba' fitokimiċi bijoattivi u 131 mira terapewtika rilevanti għall-PD li jaqsmu bejniethom; ġew identifikati ħdax-il ġene hub-qalba: HIF1A, TP53, MYC, MAPK1, HSP90AA1, FOS, EGFR, RELA, STAT1, CCND1, AKT1.

Ir-riżultati tal-analiżi tal-arrikkiment indikaw li dan il-par erbali jimmodula diversi avvenimenti bijoloġiċi inkluż stress tal-ispeċi tal-ossiġenu reattiv, newro-infjammazzjoni, awtofaġija u apoptożi. Il-mogħdijiet ta' sinjalazzjoni AGE-RAGE, PI3K-Akt, MAPK, TNF u IL-17 jipparteċipaw fil-proċess farmakoloġiku anti-PD tiegħu.

It-tbassir tal-affinità tal-irbit CNN_CNN_BindingDB ta' tagħlim fil-fond ivvalidat li fitokimiċi rappreżentattivi bħal -sitosterol u quercetin juru kapaċità ta' rbit favorevoli għall-proteini ewlenin tal-mira tal-hub.

Il-Cistanche deserticola-Angelica sinensispar veġetali jittratta l-PD permezz ta' mudell olistiku multi-kompost-multi-target-multi-pathway. Din ir-riċerka in-silico toffri referenza komputazzjonali għal aktar verifika sperimentali u żvilupp ta 'aġenti newroprotettivi ta' oriġini TCM għall-intervent tal-marda ta 'Parkinson.

Referenzi

[1] Kummissjoni tal-Farmakopea tar-Repubblika Popolari taċ-Ċina. Farmakopea Ċiniża (Volum I)[M]. Beijing: China Medical Science Press, 2020.

[2] Jenkins H E, Tolman A W, Yuen C M, et al. Inċidenza ta' mard ta' tuberkulożi reżistenti għal ħafna mediċini fit-tfal: reviżjoni sistematika u stimi globali[J]. Lancet, 2014, 383(9928):1572‑1579.

[3] Donovan J T, Thu D D A, Phu N H, et al. Xpert MTB/RIF Ultra kontra Xpert MTB/RIF għad-dijanjosi ta' meninġite tuberkulosa: studju prospettiv, randomised, ta' preċiżjoni dijanjostika[J]. Lancet Infectious Diseases, 2020, 20(3):299-307.

[4] Wang L J, Yi H Y, Liang X J, et al. Plasma TNF- u phosphorylated -syn huma assoċjati ma 'għeja f'pazjenti bil-marda ta' Parkinson[J]. Ġurnal tan-Newroimmunoloġija, 2023, 385:578222.

[5] Chen J, Zheng Z W, Li M Q, et al. Disinn, sintesi u evalwazzjoni ta' komposti ta' monokene bħala aġenti potenzjali ġodda tal-marda ta' Parkinson billi jrażżnu l-istress ER permezz ta' AKT[J]. Kimika Bijoorganika, 2023,136:106543.

[6] Wang Z F, Huang P E, Wang N B, et al. ‑asarone jinibixxi l-awtofaġija billi jattiva l-mogħdija PI3K/Akt/mTOR f'mudell tal-firien ta' depressjoni fil-marda ta' Parkinson[J]. Riċerka tal-Imġieba tal-Imġieba, 2024,465:114966.